公报说，一九九九年，中国降水份布呈现北少南多的极不均匀状态，江西、安徽、浙江、广西、广东、云南等省区 的部份地区年降水量超过二千毫米，较常年偏多百分之二十五；与此相反，河北平原及山西、辽宁等省的部份地区仅二百至三百毫米，较常年偏少百分之五十左右。夏季，北方地区降水出现了一九四九年以来的最小值，江淮、黄淮、华北等地的大部地区夏旱严重；长江流域大部地区降水过程频繁，自一九九八年大洪水之后，一九九九年又是一个多雨年。

一九九九年入汛后，长江中下游、太湖流域一带大到暴雨频繁，长江流域夏季降水量仅次于一九五四年和一九九八年，居一九四九年以来第三位。太湖流域发生了百年一遇的特大洪水，长江中下游出现仅次于一九九八年的历史第二高水位。

公报认为，一九九九年，全国灾情属一般偏重年份，以旱灾较为突出。从农业生产角度来看，年内热量条件较为充足，但阶段性变化明显，部份地区遭受了高温或低温霜冻危害，全国大部份地区光水欠足，气候条件属一般偏差年景。

公报说，一九九九年，中国境内共发生五级以上（含五级）地震七十二次。其中发生在台湾省域四十八次，台湾海峡一次，黄海一次，大陆地区二十二次。发生六级以上（含六级）地震十五次，其中大陆地区一次，其余十四次皆发生在台湾省域。台湾省域本年度地震活动频繁，大陆地区地震活动总体水平较一九九八年有所降。

一九九九年，中国大陆地区有十五次地震成灾事件，共造成五十一点一万人受灾，其中三人死亡，二十三人重伤， 一百一十四人轻伤；二万七千七百六十四平方米房屋毁坏，十四万一千一百五十一平方米严重破坏，七十七万七千零二 十二平方米中等破坏；地震灾害直接经济损失四点五九亿元人民币。

此外，一九九九年，全国共发生较大规模突发性地质灾害三百二十起，造八百二十三人死亡。