1987年清华大学陆祖荫、赵南明教授等发现液晶分子及复杂的生物大分子（如DNA脂质体）的分子结构在外气的作用下发生改变，细胞膜结构形式发生变化，DNA分子硷基氢键断裂。用激光拉曼图谱仪分析外气对有机溶液的影响，发现外气可导致有机溶液中分子键的断裂和生成。86年12月到87年1月，他们让气功师在距离实验室6公里处发功， 结果表明外气可以使内腔式激光管发射的激光偏振面转动。北京理工大学谢焕章、何庆年等研究外气对植物种子的影响发现外气使甜菜、大豆的增产效果明显，达50%左右，最高达143%，且外气处理后的幼苗抗寒能力大大增强。

刘国隆、张秉坤等对气功的神经生理机制進行了深入的研究。气功态下大脑皮层前额叶功率谱突出变化，大脑皮层感觉区域处于一种清醒状态下的抑制状态，屏蔽了外来的干扰信息。 体感区在广泛抑制的基础上存在局部的易化（指可兴奋细胞或组织处于易于兴奋的状态）区。大脑皮层额叶皮层联合区有序度上升。脑干的广泛区域处于易化状态。脑干是机体功能调节的枢纽，是功能的高位整合中枢。脑干处于易化状态，就会导致非气功态时的阙下刺激变成阙上刺激，从而产生气功态下的各种特殊感觉，如气血的经络运行等。另外调节肌肉紧张与运动功能的脊髓在内养气功中表现为抑制状态；而在习武气功中表现为易化状态。潘朝政的实验研究显示气功可以良性调节人体内体液及激素水平，对病人康复有良好效果。美国哈佛大学H.Benson等1971年发现气功态中人体脑电波α波强度增加，频率下降；入静时体感诱发电位SEP各成份受到抑制，大脑皮层有序化程度升高，基础代谢率下降，蛋白质更新率下降，新陈代谢率下降，热力学分析表明熵的增加率下降，实现了负熵化。英国实验物理学家汉斯特和理论物理学家波姆探测到气功师的核辐射粒子、 X射线。

气功外气的穿透力实验，发现外气可以穿透20厘米厚的铅板。现在的物理手段还能从功中探测出其它各种物质，如高低频电磁波、红外辐射、次声振动、微弱可见光等。气功师的功可以杀死病菌、抑制癌细胞的增殖。功还可以改变金属内的原子排列次序 。